В городе Новосибирске

Географическое название, которое стоит после слов «город», «река», «деревня» и т. д., согласуется с ними по падежам. Это правило распространяется на исконно русские или давно заимствованные топонимы. Например: в городе Новосибирске, в реке Лене. В городе Новосибирске